Il Parco Marino Tunku Abdul Rahman protegge cinque isole boschive situate da tre a otto chilometri al largo di Kota Kinabalu; le loro barriere coralline frangenti sono state stabilite come acque protette nel 1974 per preservare la biodiversità corallina di Sabah. Il parco copre 4.929 ettari di fondale basso del Mare di Sulu, dove i coralli duri crescono in fasce lungo scarpate di granito e i coralli molli popolano i canali sabbiosi tra le isole. Sapi e Manukan, le due più vicine al Jesselton Point, ospitano gli ormeggi per visitatori più densi e le barriere coralline domestiche più accessibili: profondità che variano da due a dodici metri sopra giardini di corallo che sostengono pesci pagliaccio, pesci pappagallo e cernie giovanili. Gli itinerari di mezza giornata di snorkeling a Kota Kinabalu si concentrano su queste due isole perché le traversate in traghetto richiedono dai quindici ai venti minuti, massimizzando il tempo in acqua entro una finestra di quattro ore. Le partenze mattutine si allineano con le condizioni più calme del parco: i venti alisei orientali calano prima di mezzogiorno e la visibilità raggiunge il picco tra i dieci e i quindici metri quando il plancton non è ancora fiorito sotto il sole di mezzogiorno. La tassa di conservazione di 25 MYR per adulto internazionale finanzia la manutenzione degli ormeggi e il monitoraggio della barriera corallina condotto dai ranger di Sabah Parks di stanza su ciascuna isola. La spiaggia meridionale di Sapi offre il punto di ingresso più basso: un pendio di sabbia che scende gradualmente fino a tre metri dove i coralli a tavola formano altipiani sopra la sabbia bianca. La costa orientale di Manukan ospita un profilo più ripido, con coralli cerebriformi e grappoli di corallo staghorn che iniziano a un metro ed si estendono fino a una sporgenza di sei metri dove banchi di pesci farfalla e pesci balestra nuotano vicino agli affioramenti calcarei. Entrambi i siti si trovano all'interno di zone di snorkeling designate contrassegnate da boe di superficie, che separano i nuotatori dalle corsie dei motoscafi che servono le otto corse giornaliere dei traghetti del parco. Gli eventi di sbiancamento dei coralli nel 2016 e nel 2020 hanno ridotto la copertura corallina viva di circa il trenta percento in tutto il parco, ma il recupero è visibile nella crescita di nuovi polipi lungo la barriera nord di Manukan e il muro del canale di Sapi. I regolamenti del parco marino vietano l'ancoraggio al di fuori delle zone designate, nutrire i pesci o raccogliere conchiglie, con multe applicate da barche di pattuglia che circondano le isole ogni ora. Queste protezioni hanno stabilizzato la salute della barriera corallina dal 2022 e i sondaggi sulla biodiversità contano ora oltre duecento specie di pesci associati ai coralli in tutto il complesso delle cinque isole.